藥物本身的原因。藥物具有兩重性，既能產(chǎn)生療效也有可能對人體產(chǎn)生一定危害。
中藥中的化學成分較為復雜，往往某些有效成分正式制毒因素，俗話說是藥三分毒，藥物與毒物其實并無本質(zhì)區(qū)別，常常只是量的差異在濫用誤用不合理的配置，炮制不當及給藥途徑，藥品品質(zhì)差異等諸多因素影響下，藥物的藥理作用增強，藥物就有可能變成毒物，出現(xiàn)毒副反應，導致藥源性疾病。
許多毒中藥如烏頭，附子，萬年青，七葉一枝花，黃藥子等引起中毒或死亡的報道經(jīng)常見。品種混亂，由于歷史的原因中藥品種混亂同名異物，同物異名的現(xiàn)象較為普遍。
炮制不當。中藥炮制是降低或消除藥物毒性的有效方法，一些有毒重要尤其是毒性較強的中藥，如川烏，草烏，半夏，附子，馬錢子，巴豆等多需加工炮制后使用，如未經(jīng)炮制和炮制不規(guī)范就很容易引起藥源性疾病。
藥物的不合理使用誤用和濫用藥物是引起藥源性疾病的主要原因。長期以來人們在中藥的應用上存在一些誤區(qū)，有人認為中藥不過是樹皮草根，用多用少沒有關(guān)系，也有人認為中藥沒有毒性，沒有毒副作用，用中藥有病能治病，沒病能強身，因此長期用藥，超級量用藥的情況較為普遍。
