診斷感染性心內(nèi)膜炎最重要的方法血培養(yǎng)，血培養(yǎng)是診斷菌血癥和感染性心內(nèi)膜炎最重要的方法，在近期被接受過抗生素治療的患者血培養(yǎng)陽性率可高達(dá)95%以上，其中90%以上患者的陽性結(jié)果和自入院后第一日采取的標(biāo)本，對于未經(jīng)治療的亞急性患者應(yīng)在第一日間隔1小時采血一次，共三次，次日未見細(xì)菌生長，重復(fù)采血三次后開始抗生素治療。
已用過抗生素的患者停藥兩到七天后采血，急性患者應(yīng)在入院后3小時內(nèi)每隔1小時一次，共三個血標(biāo)本后開始治療。菌血癥為持續(xù)性，無需在體溫升高時采血，每次取靜脈血十到二十毫升做需氧和厭氧培養(yǎng)，至少應(yīng)該培養(yǎng)三周，必要時培養(yǎng)基需補充特殊營養(yǎng)或采用特殊培養(yǎng)技術(shù)血。培養(yǎng)陰性率為2.5%到64%，念珠菌、霉菌、細(xì)胞胞漿菌所致病時血培養(yǎng)陰性，兩周內(nèi)用過抗生素和采血培養(yǎng)技術(shù)不當(dāng)，常降低血培養(yǎng)的陽性率。
